El 26 de diciembre de 2019 el exgobernador de Santander, Hugo Heliodoro Aguilar Naranjo, presentó una solicitud de sometimiento a la Jurisdicción Especial para la Paz (JEP) para comparecer como agente del Estado no integrante de la Fuerza Pública. Sin embargo, tal sometimiento fue rechazado al considerar poco suficientes sus aportes a la verdad. Por lo tanto, los procesos adelantados en su contra se mantuvieron en la justicia penal ordinaria.
Sin embargo, Aguilar Naranjo insistió ante la JEP su posibilidad de decir lo que sabe respecto al conflicto armado y apeló la decisión, recurso que hoy prosperó y tendrá una segunda oportunidad. Durante una audiencia única de verdad, el exfuncionario podrá declarar de forma voluntaria y el tribunal especial evaluará, nuevamente, si lo acepta.
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Esto quiere decir que la Sala de Definición de Situaciones Jurídicas deberá realizar, mediante Sala Plena o Subsala, una audiencia pública, única y definitiva, de aporte a la verdad plena, con participación del Ministerio Público. En la diligencia, el exmandatario departamental podrá aclarar, ampliar, corregir, profundizar y complementar su aporte a la verdad y a la consecución de los demás fines del Sistema Integral de Paz.
La JEP también remitió a la Unidad de Búsqueda de Personas dadas por Desaparecidas, copia del compromiso remitido por el exfuncionario y de sus anexos, ya que contiene el informe pericial sobre las zonas donde podrían encontrarse fosas clandestinas utilizadas por las Autodefensas Unidas de Colombia (AUC).
En 2022, el exgobernador de Santander quedó libre tras cumplir una pena de nueve años de cárcel que le impuso la Corte Suprema de Justicia por sus vínculos con paramilitares del Bloque Central Bolívar mientras hizo parte de la Policía. En su contra avanzan, al menos, otros dos procesos, uno por lavado de activos y otro por irregularidades en la creación del Parque Nacional Chicamocha.
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Para ese mismo año, el mismo Aguilar reconoció ante la Comisión de la Verdad varios hechos relacionados con su condena por paramilitarismo. Este hombre se refirió a su relación con el Bloque Central Bolívar de las AUC y reconoció que, a través de presiones de los paramilitares a los electores, consiguió convertirse en gobernador del departamento de Santander en 2004.
Su segunda oportunidad en la JEP se dio a conocer justo cuando la Corte Suprema de Justicia adelanta una investigación contra su hijo, el actual gobernador de Santander, Mauricio Aguilar. Un total de 15 testigos son escuchados en Bucaramanga dentro de la investigación que contra Aguilar hijo, y la exsenadora del antiguo partido político PIN, Doris Vega, por presuntos nexos con grupos armados paramilitares entre 2009 y 2010.
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